Di SMK Prajnaparamita tidak hanya membekali peserta didiknya dengan kegiatan pembelajaran intrakurikuler. Akan tetapi, kami juga menyediakan kegiatan untuk memfasilitasi bakat dan minat peserta didik. Kegiatan tersebut terangkum dalam kegiatan Ekstrakurikuler yang terbentuk berdasarkan hasil kuisioner yang di berikan kepada peserta didik. Kegiatan ekstrakurikuler tersebut dilengkapi dengan pelatih yang kompeten di bidangnya sebagai bentuk dukungan sekolah terhadap perkembangan bakat dan minat siswa. Dengan adanya kegiatan ekstrakurikuler yang berkualitas dan didukung oleh pelatih yang kompeten, diharapkan dapat menunjang prestasi siswa dalam bidang non-kognitif. Ekstrakurikuler di SMK Prajnaparamita meliputi:

1. Ekstrakurikuler Badminton
2. Ekstrakurikuler Banjari
3. Ekstrakurikuler Musik
4. Ekstrakurikuler Tari
5. Ekstrakurikuler Futsal
6. Ekstrakurikuler Basket
7. Ekstrakurikuler Voli
8. Ekstrakurikuler E-Sport